頸南地方の末門や門徒を支配統轄するために、貞享２年（西暦1685年）に開基された別院です。境内には親鸞聖人ゆかりの恵信尼の御堂や新井出身の画家・森蘭斎の墓もあります。毎年11月には「おたや」が開かれ、新井別院に続く中町、下町通りには、およそ200もの露店が立ち並び、別院では、恵信尼堂の法要や戦没者追悼の法要がとり行われ、人々は沿道をにぎやかに行き交います。